Dirençli Scooby-Doo ve arkadaşları yeniden bir maceraya atılıyor. Ancak bu sefer planları yolculuklarının en başında değişir: Araba, uzay sinyallerini sabitleyen istasyondan çok da uzak olmayan bir yerde bir kaza geçirir. Ve hepsi, uçan bir daireye benzeyen ve bir kaktüse çarptıkları için dikkatleri dağıldı. Yerlilerle konuştuktan sonra arkadaşların kafası daha da karışıyor. Bu nedenle, içinde bulundukları çöl, yürümek için en gözde yer değil ve uzaylılar tarafından kaçırılan insanlarla ilgili hikayeler uzun zamandır yerel bir cazibe merkezi haline geldi. Şimdi arkadaşlar, gizli nesnelerin yüksek duvarlarının arkasında gerçekte neler olduğunu bulmak zorunda.